PMO-Dock：评估分子对接优化、特异性与泛化能力的基准与协议

研究团队推出面向分子优化的 PMO-Dock 评测基准与协议，包含涵盖苗头化合物生成、先导化合物优化与靶点特异性优化的 25 项对接任务。该协议将超参数调优的验证任务与最终留出的测试任务严格区分，并在受限计算预算下评估了强化学习、扩散模型、GFlowNet 和大语言模型等四种优化范式。评测结果表明不同范式在各任务上各有优劣，且超参数跨任务迁移效果普遍受限。