arXiv · AI×医药交叉论文· Yossra Gharbi·· 21 小时前AI 评分49
TACFormer：基于 Transformer 架构的靶点条件从头 PROTAC 设计生成模型
TACFormer: Transformer-Based Generative Model for Target-Conditioned De Novo PROTAC Design
AI 导读
研究提出基于 Transformer 架构的从头 PROTAC 设计生成模型 TACFormer，可直接依据靶点蛋白质信息引导完整降解剂分子的生成。该模型将预训练 ESM-2 提取的靶蛋白（POI）序列表示作为条件引入 GPT 风格分子解码器，摆脱了以往方法预先固定弹头和 E3 连接酶配体、仅生成连接子的限制。结果表明 TACFormer 生成的分子兼具高新颖性与化学多样性，并能外推至全新化学型。
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