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Nature Biotechnology· Alireza Karbalayghareh·· 15 小时前AI 评分61

DynaVelo单细胞多组学动力学模型实现B细胞功能缺失与拯救扰动预测

Deep dynamical models of single-cell multiomic velocities predict loss-of-function and rescue perturbations in B cells

AI 导读

研究团队开发了基于神经常微分方程的单细胞多组学深度学习模型 DynaVelo,可联合转录组与转录因子基序可及性推断细胞命运轨迹并预测遗传扰动结果。该模型在小鼠生发中心 B 细胞中复现了细胞状态转换与调控网络,揭示了 Arid1a 与 Ctcf 突变破坏细胞再循环的机制。计算模拟进一步筛选出 Bcl6、Stat3 和 Ctcf 作为潜在拯救靶点,并在体内小鼠模型中验证了其恢复异常表型的有效性。

来源:Nature Biotechnology · nature.com